El MUPA tiene, como cualquier museo, la obligación de facilitar el acceso a las piezas de su colección con fines de investigación. Cada año son cientos los fósiles que han sido estudiados, con diferentes tipos de intervenciones. Los investigadores interesados en el estudio de cualquier pieza de la colección, tanto de las expuestas en vitrina como las conservadas en sus almacenes, deben contactar con el museo para solicitar el ACCESO a FONDOS del museo.
Otras de las funciones que asume el MUPA es la recepción de las piezas que surgen en los hallazgos casuales, y aquellas que son fruto de proyectos de investigación paleontológica previamente autorizados por la Consejería, proceso en el que el museo aporta para la identificación de cada pieza la sigla correspondiente. Todo ello con el ánimo de prestar el mejor servicio a los equipos de investigación y al patrimonio de nuestra región